Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms