Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms