Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms