Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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