Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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KLHL28Q9NXS3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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KLHL28Q9NXS3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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