Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms