Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms