Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
BCO2Q9BYV7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BCO2Q9BYV7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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