Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms