Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms