Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms