Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms