Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms