Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms