Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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