Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPRD1AQ96P16 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms