Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms