Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms