Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNOT9Q92600 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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