Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTC21AQ8NDW8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms