Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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