Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APTXQ7Z2E3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms