Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms