Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms