Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms