Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms