Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms