Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms