Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LTC4SQ16873 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms