Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FSCN1Q16658 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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