Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SSX1Q16384 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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