Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA2Q15822 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA2Q15822 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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