Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms