Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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