Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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