Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR5A1Q13285 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms