Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TROQ12816 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TROQ12816 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TROQ12816 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TROQ12816 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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