Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms