Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PSME1Q06323 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSME1Q06323 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSME1Q06323 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSME1Q06323 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSME1Q06323 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME1Q06323 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms