Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE3AQ05086 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms