Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms