Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPCQ01831 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPCQ01831 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms