Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFITM3Q01628 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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