Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms