Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms