Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms