Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GSCP56915 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GSCP56915 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GSCP56915 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GSCP56915 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms