Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTTPP55157 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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