Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAG1P54619 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKAG1P54619 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKAG1P54619 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms