Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms